In de Medezeggenschapsraad (MR) hebben twee ouders en twee personeelsleden zitting voor een periode van twee jaar. De MR overlegt met de directie en het schoolbestuur over zaken, zoals de besteding van geld, verbeteringen en veranderingen in het onderwijs, het vaststellen van vakanties en vrije dagen. De vergaderingen van de MR zijn openbaar. De agenda en de notulen staan (de laatste zodra ze op een volgende vergadering zijn goedgekeurd) op de website.
De directeur van OBS Archipel, woont de vergaderingen van de MR als adviseur bij. Zij vertegenwoordigt ook het schoolbestuur met betrekking tot een aantal bovenschoolse zaken.
Sinds januari 2006 is er een Gemeenschappelijke Medezeggenschapsraad (GMR), waarin MR-leden van de scholen vallend onder Stichting de Haagse Scholen vertegenwoordigd zijn.